Προετοιμασία βιβλιοθηκών NGS

Η αλληλούχιση νέας γενιάς απαιτεί προσεκτική προετοιμασία του γενετικού υλικού πριν από την αντίδραση αλληλούχισης για να διασφαλιστούν αξιόπιστα αποτελέσματα. Η υψηλής απόδοσης αλληλούχιση πραγματοποιείται σε ομοιογενή κομμάτια που έχουν στα άκρα τους σύντομες ακολουθίες που ονομάζονται ετικέτες, οι οποίες επιτρέπουν τον προσδιορισμό της προέλευσης των κομματιών κατά την ταυτόχρονη αλληλούχιση πολλών δειγμάτων, τη στερέωση σε στερεό υποστρώμα και την αρχικοποίηση της αντίδρασης αλληλούχισης μέσω της ενσωμάτωσης επισημασμένων dNTPs. Για να παραχθούν αυτά τα κομμάτια που αποτελούν αυτό που ονομάζεται βιβλιοθήκη, υπάρχουν διάφορες προσεγγίσεις, όπως για παράδειγμα: Η προετοιμασία βιβλιοθηκών μέσω θραύσης: το γενετικό υλικό αρχικά κόβεται σε κομμάτια διαφόρων μεγεθών. Η θραύση μπορεί να είναι μηχανική, χημική ή ενζυμική. Μια επιλογή των κομματιών γίνεται ανάλογα με το μέγεθός τους. Το τελευταίο βήμα περιλαμβάνει την προσθήκη ετικετών στα...